厭氧流化床的優點如下：
(1)占地面積少厭氧流化床允許有很高的容積負荷，去除率高，其占地面積約爲普通活性汙泥法的5%左右。
(2)工藝穩定性好能抗有機或有毒負荷的沖擊，生物顆粒的流態化，促進了生物膜與汙水界面的不斷更新，有利于加速厭氧消化，避免了固定床消化器中經常出現的底部負荷過重的狀態，從而增強了有機負荷和有毒負荷沖擊的承受能力。
(3)水力停留時間短生物粒子在反應器中呈流態化，提高了傳質速度，從而縮短了水力停留時間。
(4)對各種廢水具有很好的適應性反應器不僅可以用于處理高濃度廢水，也可以用于處理低濃度廢水（CODClOOOmg/L),既能用于一般的廢水處理，也能用于有毒廢水處理（如含酚廢水）。
(5)去除率很高這是由于小顆粒載體爲微生物的固定化提供了巨大的表面，使得流化床中的生物質濃度很高，可達10～40g/L。
其缺點主要是啓動困難，所需時間長。由于水力剪力的作用，生物膜不能迅速形成，在反應器中，要獲得穩定、成熟的生物膜，有時需要長達6個月時間。保持流化態會需要大量能量，能耗大。生物膜厚度控制困難。工業性操作經驗缺乏。載體選擇不當，還會出現成本過高等問題。
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