C、N、P三種營養物質之間的比例，無論是好氧反應還是厭氧反應，N、P的比值是確定的，爲5:1。C與它們的比值差別很大。首先要明白厭氧反應和好氧反應之間的差異，好氧反應的細胞合成率高，而厭氧反應的合成率低，因此厭氧反應所需的C就會高很多；另一方面，不同性質的廢水所含的C的可生物利用性不同，因此，不同性質的廢水要求的C的比值不同。大量實驗研究表明，厭氧生物處理的C:N: P控制爲（200～300): 5: 1爲宜（其中（：以COD表示，N、P以元素含量計）。在裝置啓動時，稍微增加N,有利于提高反應器的緩沖能力，有利于生物的增殖。
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